Secara administrasi potensi sumber daya air di Wilayah Kerja Balai PSDA Serayu Citanduy meliputi 2 Wilayah Sungai yakni WS Serayu (181 Km) dan WS Citanduy Timur (128 Km), yang melintasi Kabupaten Wonosobo, Banjarnegara, Purbalingga, Banyumas, Cilacap dan sebagian Kebumen. Serta mempunyai 13 Daerah Irigasi kewenangan Provinsi Jawa Tengah dengan luas areal layanan mencapai 10.463 Ha dan 4 Daerah Irigasi kewenangan pusat dengan luas areal layanan 34.859 Ha.
